一、内阁衙门：	明清两代最高中枢机构。内设太师、 太傅、太保。
二、六部衙门：	中央行政机构中分掌全国各类政务六个衙门的总称。直接听命于皇帝。分为吏部、兵部、 刑部、礼部、户部、工部。
	1．吏部：相当于组织部、人事部等部门。 2．兵部：相当于国防部、公安部、安全部、交通部、 军委等部门。 3．刑部：相当于最高法院、最高检察院、司法部等部门。 4．礼部：相当于教育部、文化部、宣传部等部门。 5．户部：相当于财政部、民政部、商务部、劳动与社会保障部、审计署、农业部、 　　　　 中国人民银行、税务总局、工商总局等部门。 6．工部：相当于建设部、国土资源部等部门。
三、都察院衙门：	相当于监察部、中纪委等部门。明清时期最高监察机构，弹劾及建议官署。清代将全国分成十五个监察区。
四、翰林院衙门：	相当于中科院、社科院等部门。在中国历史上翰林院是长期存在的，是文化层次最高的官署。明清时期翰林院主管编修国史、记载皇帝言行起居、进讲经史及草拟有关典礼的文件和册立制宪等。所属官员统称翰林。
五、九卿衙门：	六部之外的独立官署。
六、按察司衙门：	掌管一省司法、监察、驿传之务及宣抚劝农采访事等。
七、布政司衙门：	布政司的布政使，掌管一省之行政和财赋之出纳。国家政令由他向府、州、县宣布。每十年将全省户籍、税役、民数、田数，汇报于户部。各项重要政务，报于总督、巡抚议行。相当于现地方政府的民政厅、财政厅、商务厅、农业厅、林业厅、畜牧局、建设厅等部门。
八、京府衙门：	京都所属地区的办事机构，不受省管辖。府尹为最高长官，其地位比地方府要高。
九、京县衙门：	京都及其行政官署所辖地区。不受直隶省管辖。
十、外省衙门：	清代的地方行政机构一般分为省、府 （州、厅）、县三级。外省衙门是京都以外的地方最高行政机构。省一级的最高长官为总督、巡抚。总督一般掌管二至三省的行政、军事、监察大权。
十一、外府衙门：	地方行政机构。省下设府。知府为最高行政长官，掌管政务及所属州、县的赋役、诉讼等。
十二、外州衙门：	与府同级的直隶州，直属于省。最高行政长官为知州。少数民族地区设立直隶厅，直属于省。
十三、外县衙门：	府下设县，县是地方行政机构的基层组织。最高长官为知县。